A última etapa será o tratamento dos resultados. Em nosso caso, estamos interessados em agrupar as estruturas geradas de acordo com o arranjo do ...
A técnica de Docking molecular permite prever a orientação adotada por uma molécula ao se ligar à outra, e é frequentemente usado para prever a c...
Os cálculos de dinâmica molecular normalmente incluem 4 etapas:
Minimização de energia
Aquecimento
Equilibração...
Análise do modelo: pdb4amber
Em primeiro lugar, vamos analisar o modelo gerado para verificar se algum ajuste é necessário. Para isso, vamos...
Essa parte consiste de 3 etapas:
Preparo da estrutura cristalina
Complementação de resíduos não visíveis
Resta...
Ensemble Docking